S. solfataricus は、Saccharolobus 属 (旧 Sulfolobus) に属する好熱性古細菌の一種です。火山温泉やその他の酸性環境で発見され、温度約 80°C、pH 2 ～ 4 で生育できます。古細菌生物学、特に DNA の複製、転写、翻訳を研究するためのモデル生物です。
S. solfataricus の近縁種は何でしょうか?
この質問に答えるには、S. solfataricus と他の古細菌種との系統関係を調べる必要があります。これを行う 1 つの方法は、高度に保存されており、生物の進化の歴史を反映できるリボソーム RNA (rRNA) 遺伝子の配列を比較することです。 rRNA 分析に基づくと、S. solfataricus は、Crenarchaeota の 2 つの主要なグループ (もう 1 つは Taumarchaeota) の 1 つである Thermoproteota 門に属しています。サーモプロテオタ属の中で、S. solfataricus は、サーモプロテイ綱、スルフォロバレ目、スルフォロバセ科に分類されます。
S. solfataricus に最も近い近縁種は、S. acidocaldarius、S. islandicus、S. tokodaii、S. caldissimus などの Saccharolobus 属の他のメンバーです。これらの種は、rRNA 配列において 90% 以上の類似性を共有しており、同様の形態学的および生理学的特徴を持っています。また、それらは同様のゲノム サイズと構造を持ち、単一の環状染色体と多くの可動性遺伝要素を備えています。
S. solfataricus の他の近縁種には、Acidianus、Metallosphaera、Stygiolobus、Sulfurisphaera などの Sulfolobales 目の他のメンバーがいます。これらの種は、S. solfataricus との rRNA 配列の類似性が 90% 未満ですが、好熱性であること、球状または葉状の細胞を有すること、エネルギー源として硫黄または有機化合物を使用することなど、いくつかの共通の特徴を共有しています。ただし、細胞壁組成、代謝経路、ゲノム構造が異なるなど、いくつかの違いもあります。
Sulfolobales 目を超えて、S. solfataricus の近縁種はさらに遠く離れて多様になります。これらには、Thermofilum、Pyrobaculum、Thermoproteus、Caldivirga、Vulcanisaeta などの Thermoprotei 綱の他のメンバーが含まれます。サーモプロテオータ門の他のメンバー、例えばデスルフロコッカス、イグニコッカス、パイロディクチウム、スタフィロテルムス、アエロピルムなど。これらの種は、S. solfataricus との rRNA 配列の類似性が 80% 未満であり、生態的ニッチ、細胞の形状、または代謝様式が異なります。彼らはまた、サーモプロテオータ内の異なる目または科に属します。
結論
結論として、S. solfataricus に最も近縁な種は、Saccharolobus 属 (旧 Sulfolobus) の他のメンバーであり、次に同綱内の Sulfolobales 目の他のメンバーが続きます。サーモプロテオータとサーモプロテオータ門。これらの関係は rRNA 配列の比較に基づいており、形態学的、生理学的、ゲノムデータによって裏付けられています。