Η Emma Thompson λέει ότι το τέλος του γάμου της με τον σύζυγό της Kenneth Branagh ήταν το ίδιο σοκαριστικό για εκείνη όσο και για το κοινό. Η ηθοποιός, η οποία έχει προφίλ στο τελευταίο τεύχος του The New Η Yorker, είπε στο περιοδικό ότι αγνοούσε την απιστία του Branagh στα γυρίσματα ταινιών, η οποία οδήγησε στον χωρισμό τους το 1995.
Ο Thompson και ο Branagh παντρεύτηκαν το 1989 αφού συναντήθηκαν στο Fortunes of War του 1987 και αργότερα και αργότερα. Πρωταγωνίστησε στην ταινία Dead Again του 1991, την οποία σκηνοθέτησε ο Branagh. Ενώ το ισχυρό ζευγάρι παρουσίασε ένα ενιαίο μέτωπο στον Τύπο και το κοινό καθώς συνεργάζονταν για να κάνουν έξι ταινίες μαζί, η σχέση τους έληξε αφού ο Μπράνα απάτησε τον Τόμπσον ενώ γύριζε τον Φρανκενστάιν της Μαίρης Σέλλεϊ.
Ο Μπράνα, ο οποίος σκηνοθέτησε την ταινία. , έκανε σχέση με την ηθοποιό Helena Bonham Carter και συνέχισε να βγαίνει ραντεβού μαζί της για πέντε χρόνια.
Η Thompson είπε στο The New Yorker την έπιασε ξαφνικά το ρομάντζο του Branagh και της Bonham Carter στο πλατό, λέγοντας στους outlet, «Ήμουν τελείως, τελείως τυφλός στο γεγονός ότι είχε σχέσεις με άλλες γυναίκες στα γυρίσματα. Αυτό που έμαθα ήταν πόσο εύκολο είναι να τυφλωθείς από την επιθυμία σου να εξαπατήσεις τον εαυτό σου.»
Μετά τον χωρισμό της από τον Μπράνα, η Τόμσον είπε ότι ήταν «μισοζωντανή», προσθέτοντας: «Κάθε αίσθηση ότι είναι αξιαγάπητος ή άξιος άνθρωπος είχε φύγει εντελώς». Αλλά όταν γνώρισε και ερωτεύτηκε τον ηθοποιό Greg Wise, ο Thompson είπε ότι «μάζεψε τα κομμάτια και τα έβαλε ξανά μαζί».
Ο Thompson και η Wise γνωρίστηκαν στα γυρίσματα του Sense and Sensibility — στο οποίο πρωταγωνίστησε ως Η Elinor Dashwood και έπαιξε τον John Willoughby — και αργότερα παντρεύτηκαν το 2003. Ο Thompson είπε στο The New Yorker: «Έμαθα περισσότερα από τον δεύτερο γάμο μου απλώς με το να παντρευτώ. Όπως λέει η μητέρα μου, «τα πρώτα είκοσι χρόνια είναι τα πιο δύσκολα».